Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnni3P48787 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms