Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms