Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VdrP48281 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VdrP48281 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VdrP48281 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms