Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41P48193 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms