Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp2P46686 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp2P46686 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp2P46686 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp2P46686 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp2P46686 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tulp2P46686 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp2P46686 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp2P46686 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tulp2P46686 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tulp2P46686 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms