Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf1P46099 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf1P46099 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms