Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tac1P41539 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tac1P41539 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms