Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tnfsf9P41274 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tnfsf9P41274 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf9P41274 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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