Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps26aP40336 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms