Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ThpoP40226 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms