Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms