Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprkP35822 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprkP35822 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms