Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn1P35821 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms