Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptger1P35375 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms