Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab20P35295 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms