Protein–RNA interactions for Protein: P33033

Mc3r, Melanocortin receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc3rP33033 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc3rP33033 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc3rP33033 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc3rP33033 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc3rP33033 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mc3rP33033 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc3rP33033 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc3rP33033 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc3rP33033 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc3rP33033 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc3rP33033 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc3rP33033 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc3rP33033 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mc3rP33033 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc3rP33033 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc3rP33033 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc3rP33033 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc3rP33033 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc3rP33033 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms