Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rom1P32958 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rom1P32958 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rom1P32958 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms