Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa2P31245 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms