Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VtnP29788 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VtnP29788 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VtnP29788 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
VtnP29788 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VtnP29788 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VtnP29788 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VtnP29788 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VtnP29788 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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