Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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