Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Marcksl1P28667 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Marcksl1P28667 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms