Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms