Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aco1P28271 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aco1P28271 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms