Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb3P28231 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms