Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PdgfraP26618 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms