Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CftrP26361 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CftrP26361 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CftrP26361 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CftrP26361 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CftrP26361 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CftrP26361 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CftrP26361 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CftrP26361 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CftrP26361 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CftrP26361 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CftrP26361 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CftrP26361 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CftrP26361 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CftrP26361 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CftrP26361 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CftrP26361 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CftrP26361 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms