Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna1P26231 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms