Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd1P25322 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms