Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd247P24161 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms