Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms