Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ggta1P23336 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ggta1P23336 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ggta1P23336 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ggta1P23336 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ggta1P23336 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ggta1P23336 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ggta1P23336 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ggta1P23336 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ggta1P23336 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ggta1P23336 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ggta1P23336 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ggta1P23336 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ggta1P23336 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ggta1P23336 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ggta1P23336 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ggta1P23336 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ggta1P23336 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ggta1P23336 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ggta1P23336 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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