Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkchP23298 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms