Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms