Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tap1P21958 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tap1P21958 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms