Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3P21107 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms