Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP20293 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP20293 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TP20293 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TP20293 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TP20293 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TP20293 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TP20293 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TP20293 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TP20293 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TP20293 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms