Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P20040 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P20040 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P20040 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
P20040 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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