Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RargP18911 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RargP18911 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RargP18911 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms