Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rps6ka1P18653 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms