Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PcnaP17918 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcnaP17918 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PcnaP17918 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms