Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gabra6P16305 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms