Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
OtcP11725 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
OtcP11725 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
OtcP11725 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms