Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt8P11679 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt8P11679 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt8P11679 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms