Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DmdP11531 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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DmdP11531 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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DmdP11531 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DmdP11531 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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DmdP11531 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DmdP11531 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DmdP11531 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DmdP11531 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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DmdP11531 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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DmdP11531 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms