Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms