Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pla2g4bP0C871 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms