Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc8P09025 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc8P09025 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms