Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a2P08122 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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