Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms