Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprcP06800 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PtprcP06800 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PtprcP06800 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PtprcP06800 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PtprcP06800 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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PtprcP06800 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PtprcP06800 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PtprcP06800 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcP06800 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PtprcP06800 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
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PtprcP06800 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PtprcP06800 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PtprcP06800 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcP06800 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms